Femto Pulse

REVOLUTIONIZE YOUR NUCLEIC ACID ANALYSIS

FEMTO Pulse™ Automated Pulsed-Field CE Instrument는 혁신 적인 핵산 분석을 위한 제품입니다. Pulse-field 전원 조절과 자동화된 모 세관 전기영동의 결합으로, 유일한 automated pulsed-field capillary electrophoresis가 탄생하였습니다.

향상된 내부 디자인을 통해, 큰 사이즈의 DNA fragment의 분석은 물론 femtogram 범위의 농도까지 확인할 수 있습니다. Non-denaturing gel 을 기반으로 한 다른 종류의 분석 장비와 비교하였을 때, FEMTO Pulse™ 는 nucleic acid fragment 분석에 있어 약 100배 높은 민감도로 분석할 뿐 아니 라, smear 분석에서도 약 20~30배 높은 민감도를 가집니다.

FEMTO Pulse™ 의 응용 범위는 single cell total RNA 와 genomic DNA 분 석, 극소량의 NGS library (PCR-free), exosomes, small RNA, cfDNA, FFPE에서 추출된 핵산 등의 분석뿐 아니라, large DNA fragment library, BAC clones, 백신에 함유되어 있는 foreign DNA 확인, 낮은 농도 시료에서 확인된 single/multiple DNA fragment 확인 등까지 포함합니다.




 


 

PULSED-FIELD POWER FOR FAST, LARGE FRAGMENT SEPARATIONS

Pulsed-field electrophoresis는 큰 사이즈의 DNA fragment 를 분리하는데, 이미 검증된 확실한 방법입니다. FEMTO Pulse™ 만 의 pulse-field power supply 사용으로, 200,000bp의 큰 사이즈 DNA fragment는 약 2시간 안에 165,000bp의 큰 사이즈 DNA smear를 단 1시간안에 분석 할 수 있습니다.
분리 기술은 4가지 요소를 포함합니다.

1. Negative Positive 양극간의 안정적인 전압 변환, 2. 진동수 (oscillation frequency)의 규칙적인 조절, 3. 시간에 따른 진동수 (oscillation frequency)의 변화 조절, 4. 진동파 (oscillation wave) 형태 통제.


 

ACHIEVE BOUNDARY BREAKING DETECTION LEVELS

FEMTO Pulse™ 는 femtogram 수준의 높은 민감도를 위해서, excitation 및 detection을 위한 전체적인 시스템을 새롭게 디자 인 하였습니다.

• Nucleic acid를 확인하는 방법에 있어 특허 기술이 변화되었습 니다.

• 높은 강도의 illumination과 excitation을 위한 detection window에 공급되는 전원의 세기가 증가했습니다

• Detector를 통과하는 nucleic acid를 측정하고 기록하는 새로 운 소프트웨어를 적용하였습니다.

• FEMTO Pulse™ 를 위해, background noise를 최소한으로 줄인 특별하게 고안된 gel chemistry가 사용됩니다.




 


 

DETECT DNA FRAGMENTS DOWN TO 5 fg/uL

300bp fragment를 serial dilution 하여, FEMTO Pulse™의 일반적인 구동 조건으로 전기영동을 진행하였습니다. Electropherogram과 gel image를 동시에 확인할 수 있습니다. 이 실험을 위해 사용된 fragment의 각 농도는 39 fg/ul (black trace, lane 1), 19.5 fg/ul (red trace, lane 2), 9.7 fg/ul (blue trace, lane 3), 4.8 fg/ul (orange trace, lane 4). Ladder는 gel image에서 5번째 lane에 있습니다. 가장 낮은 농도는 300bp fragment가 약 15,000 molecules 가 있다는 것을 보여줍니다.


 

SEPARATE AND DETECT A SINGLE CELL’S WORTH OF GENOMIC DNA

10ul의 희석 용액 안에, 높은 분자량의 genomic DNA가 각 16 pg (red), 8 pg (black)씩 희석되어 있습니다. FEMTO Pulse™의 일반적인 구동 조건으로 전기 영동을 진행하였습니다. 이 실험에 사용된 genomic DNA 시료의 농도는 각 1.6 pg/ul (red), 0.8 pg/ul (black) 입니다. FEMTO Pulse™의 뛰어난 민감도와 해상도는 single cell genomic content가 약 175,000 bp 임 을 보여줍니다.





 


 

TOTAL RNA SEPARATION FROM A SINGLE CELL

Mouse cell에서 추출된 total RNA는 FEMTO Pulse™의 일반적인 구동 조건으로 전기영동을 진행하였습니다. 이 실험에서 5 pg/ul의 total RNA에서 2ul가 사용되었습니다. 2ul의 total RNA는 18ul의 diluent marker soultion과 혼 합되어 최종적으로 500 fg/ul로 만들어졌습니 다. 이 조건은 single cell의 total RNA 수준을 나타냅니다. Electropherogram에서 높은 품 질의 RNA를 확인할 수 있습니다. 이 시료의 높 은 수치의 RQN 또한 확인할 수 있습니다.